منتدى وندر لاند - عرض مشاركة واحدة - Helicobacter pylori

مشاهدة أوسمتي · 03-19-2022, 03:07 AM

*نسخة Transcriptome:-

في عام 2010 شارما وآخرون .قدم تحليلاً شاملاً للنسخ بدقة النوكليوتيدات المفردة بواسطة RNA-seq التفاضلي الذي أكد تحريض الحمض المعروف لمواقع الفوعة الرئيسية ، مثل مشغل اليورياز(urease)أو جزيرة الإمراض كاغ.الأهم من ذلك ،حددت هذه الدراسة إجمالي 1،907 مواقع بدء نسخ(primary operons)،و 337 مشغل أساسي (additional suboperons)،26 عملية فرعية إضافية،و66 احادي(monocistrons).

حتى عام 2010 ، لم يُعرف في هذا النوع سوى حوالي 55 موقعًا لبدء النسخ النصية -transcriptional start sites (اختصارهاTSSs).والجدير بالذكر أن 27٪ من المواد الصلبة الذائبة الصافية الأولية عبارة عن مواد صلبة صلبة صغيرة مضادة للحساسية،مما يشير إلى أنه - على غرار الإشريكية القولونية (Escherichia coliاختصارها E.coli)يحدث النسخ المضاد للحساسية عبر جينوم هيليكوباكتر بيلوري بأكمله.

يرتبط TSS واحد على الأقل بمضادات الحساسية بحوالي 46٪ من جميع إطارات القراءة المفتوحة ، بما في ذلك العديد من جينات التدبير المنزلي. معظم (حوالي 50 ٪) من 5-UTRs هي 20-40 نيوكليوتيد (nt) في الطول وتدعم شكل AAGGag الموجود على بعد حوالي 6 nt (مسافة متوسطة) من المنبع من كودونات البداية كتسلسل Shine – Dalgarno المتفق عليه في هيليكوباكتر بيلوري.

*الجينات المشاركة في الفوعة والتسببGenes involved in virulence and pathogenesis:-

تتركز دراسة جينوم هيليكوباكتر بيلوري على محاولات فهم التسبب في المرض،وقدرة هذا الكائن الحي على التسبب في المرض. حوالي 29 ٪ من المواقع لديها خلل في الاستعمار عند حدوث طفرة. تحتوي اثنتان من السلالات المتسلسلة على جزيرة Cag المُمرضة يبلغ طولها حوالي 40 كيلو بايت (تسلسل جيني شائع يعتقد أنه مسؤول عن التسبب في المرض) يحتوي على أكثر من 40 جينًا. غالبًا ما تكون جزيرة الإمراضية هذه غائبة عن سلالات الحلزونية البوابية المعزولة من البشر الذين يحملون هيليكوباكتر بيلوري ، ولكنها تظل بدون أعراض.

رموز الجين cagA لواحد من بروتينات الفوعة الرئيسية هيليكوباكتر بيلوري. ترتبط السلالات البكتيرية مع الجين cagA بالقدرة على التسبب في القرحة.يرمز الجين cagA لبروتين طويل نسبيًا (1186 - حمض أميني). تحتوي جزيرة الإمراض (cag-PAI) على حوالي 30 جينًا،جزء منها رمز لنظام إفراز معقد من النوع الرابع. يشير المحتوى المنخفض من GC لـ PAI cag بالنسبة لبقية جينوم هيليكوباكتر بيلوري إلى أن الجزيرة قد تم الحصول عليها عن طريق النقل الأفقي من نوع بكتيري آخر. يلعب بروتين سيرين بروتياز HtrA أيضًا دورًا رئيسيًا في التسبب في الإصابة بالبكتيريا الحلزونية البوابية. يمكّن بروتين HtrA البكتيريا من الانتقال عبر ظهارة الخلايا المضيفة ، وهو ضروري أيضًا لانتقال CagA.

رموز الجينات vacA (Q48245) لبروتين فوعة آخر هيليكوباكتر بيلوري. هناك أربعة أنواع فرعية رئيسية من ( vacA: s1/m1, s1/m2, s2/m1, and s2/m2. s1/m1 and s1/m2) تسبب زيادة خطر الإصابة بسرطان المعدة. وقد تم ربط هذا بقدرة المواد السامة المفرغة على تعزيز تكوين الخزانات داخل الخلايا من الحلزونية البوابية عن طريق تعطيل قناة الكالسيوم TRPML1.

*بروتين Proteome :-

تم تحليل بروتينات هيليكوباكتر بيلوري بشكل منهجي من خلال دراسات متعددة. نتيجة لذلك،تم الكشف عن أكثر من 70٪ من البروتين بواسطة مطياف الكتلة وطرق كيميائية حيوية أخرى.في الواقع،تم تحديد كمية حوالي 50٪ من البروتين،أي أننا نعرف عدد نسخ كل بروتين موجودة في خلية نموذجية. علاوة على ذلك،تمت دراسة تفاعل هيليكوباكتر بيلوري بشكل منهجي وتم تحديد أكثر من 3000 تفاعل بروتين-بروتين.

يوفر الأخير معلومات عن كيفية تفاعل البروتينات مع بعضها البعض،على سبيل المثال في مجمعات بروتينية مستقرة أو في تفاعلات عابرة وديناميكية. وهذا بدوره يساعد الباحثين على معرفة وظيفة البروتينات غير المميزة،على سبيل المثال.

عندما يتفاعل بروتين غير مميز مع العديد من بروتينات الريبوسوم (أي أنه من المحتمل أيضًا أن يشارك في وظيفة الريبوسوم). ومع ذلك ، فإن حوالي ثلث جميع البروتينات البالغ عددها 1500 في هيليكوباكتر بيلوري تظل غير مميزة ووظيفتها غير معروفة إلى حد كبير.